editorconfigに怒られてるが、インデント調整を手でやるのがめんどい。vimでうまくやれないか（プラグイン無しで）調べていたら、tabstop=4として、
vim -c 'normal! gg=G' -c ':wq' CMakeLists.txt
で行けることが分かった。-cはvim起動時にコマンドを実行するコマンド。'normal'はノーマルコマンドをぶち込む。gg=Gでファイル全体をインデント。':wq'で保存して終了。
vimのインデントの挙動もすこし辛かったのでいじった。 ここ 参照。